Ако бъде създадена централизирана институция, която да поеме работата по европейски проекти, то тя ще бъде неефективна за поне шест месеца. Това прогнозират икономистите от Capital Partners по повод идеята, лансирана от различни фигури в публичното пространство.
Подобна структура, която функционира като мега-агенция или мега-министерство, се прилага в прибалтийските републики, които са избрали този модел, защото нямат достатъчен административен капацитет. Приложението й в България се обосновава с факта, че със сегашния капацитет и организация се усвояват не повече от 50% от отпуснатите средства.
Предимство на централизацията е, че реализират съществени икономии. Вземането на управленски решения става много по бързо, а координацията между отделните програми, като например проверките за двойно финансиране, ще бъдат значително по ефективни.
Проблем пред сформирането на такава институция у нас е че това налага ударно да се променят всички закони, наредби и постановления на Министерски съвет, които касаят прилагането на програмите. Вторият проблем това е нуждата от промяна в стратегиите за одит и оценки за съответствие на оперативните програми, които могат да бъдат модифицирани и коригирани от страна на администрацията и повторно изпратени в Брюксел за одобрение в минимален срок от 6 месеца. Всичко това ще направи новият орган неефективен за период поне от шест месеца, докато административните подробности бъдат уточнени с Брюксел.
Чисто технически, най-подходящото време за промени за изграждане на единна структура е след междинната оценка на всички оперативните програми, а именно в края на 2010 година, или в началото на следващия програмен период 2013-2020 година, смятат още от Capital Partners.